高分辨质谱通过同位素丰度匹配可确定未知物的化学式（分子式），并对有机物成分进行精确质量数分析，是进行化学结构分析的最重要的配套手段之一。高分辨质谱仪与液相色谱联用还可对复杂的混合体系进行快速高效的分离与定量，广泛应用于合成药物、抗生素、中药和天然药物、药物动力学研究，也应用于蛋白质组学研究、食品安全、环境、生物大分子、兴奋剂、毒品、有机合成等领域。